Ученые нашей теоретической группы и Новосибирского института органической химии СО РАН разработали комплексную методологию, сочетающую молекулярную динамику и квантовую химию, для изучения взаимодействия противовирусного препарата «Арбидол» с аминокислотами белков вирусов гриппа и SARS-CoV-2.
Новый метод объединяет докинг, классическую молекулярную динамику и расчеты в рамках теории функционала плотности, что позволяет исследовать динамику и энергетику межмолекулярных взаимодействий. Впервые ученые детально описали пространственную структуру, сольватацию и конформационное поведение комплексов «Арбидола» с ключевыми аминокислотами — триптофаном, тирозином, фенилаланином и валином.
Этот подход способствует развитию компьютерного дизайна лекарств, позволяя точно предсказывать взаимодействие молекул с мишенями и создавать более эффективные и безопасные противовирусные препараты.