Молекулярный докинг используется для оценки аффинности того или иного лиганда к сайту связывания в определенном белке (ферменте или рецепторе). Мы владеем всеми алгоритмами и протоколами молекулярного докинга, начиная с классического полугибкого докинга, позволяющего, например, оценить аффинность производных гликоцирретиновой кислоты к активному сайту NS2B-NS3 вируса Зика:
doi.org/10.1016/j.bmc.2021.116204. Протоколы принудительного докинга позволили нам объяснить механизм противовирусной активности ряда производных камфецина против вируса Эбола и вируса гриппа:
doi.org/10.3390/molecules26082235